Produktintroduktion
|
Produktnavn |
Kat. Ingen. |
Spec. |
|
2×SYBR Grøn qPCR Master Mix (Ingen ROX) |
G3320-01 |
1 ml |
|
G3320-05 |
5×1 ml |
|
|
G3320-15 |
15×1 ml |
Produktbeskrivelse/Introduktion
2×SYBR Green qPCR Master Mix (Ingen ROX) er en speciel 2× premix til qPCR-reaktion ved brug af SYBR Green I kimærisk fluorescensmetode, som indeholder alle qPCR-komponenter undtagen primere og DNA-skabeloner, som kan reducere operationstrinnene, forkorte tiden for tilføje prøver og reducere risikoen for kontaminering. Kernekomponenten er gensplejset hot-start Taq DNA Polymerase, som effektivt lukker DNA-polymeraseaktivitet og forhindrer uspecifik amplifikation ved lave temperaturer ved effektivt at
kombinerer monoklonalt antistof og Taq DNA Polymerase, med mange fordele såsom høj specificitet og høj sensitivitet, og er koblet med en reaktionsbuffer optimeret til qPCR. Det er meget velegnet til høj specificitet og høj sensitivitet qPCR reaktion. Dette produkt er et 2x forblandet reagens indeholdende den optimale koncentration af SYBR Green I til qPCR-reaktion, som kan opnå en god standardkurve i et bredt kvantificeringsområde, nøjagtig kvantificering af målgener, god reproducerbarhed og høj tillid.
Opbevarings- og forsendelsesbetingelser
Skib med våd is. Opbevares ved -20 grader uden lys, gyldig i 12 måneder. Undgå fryse-tø-cyklusser. Efter optøning kan den opbevares stabilt ved 4 grader i en måned uden lys.
Produktindhold
|
Komponent |
G3320-01 |
G3320-05 |
G3320-15 |
|
2×SYBR Grøn qPCR Master Mix (Ingen ROX) |
1 ml |
5×1 ml |
15×1 ml |
|
Manuel |
Ét eksemplar |
||
Analyseprotokol/procedurer
Inden start
1. Real-Time PCR-amplifikationsapparat;
2. Specielt reaktionsrør eller reaktionsplade til forsøg;
3. PCR-primere (referenceprimerdesignprincipper);
4. Mikropipette og autoklaveringsspidser;
Procedurer
1. Anbefal qPCR-reaktionssystemet:
|
Komponent |
20 μL rxn |
50 μL rxn |
Endelig koncentration |
|
2×SYBR Grøn qPCR Master Mix (Ingen ROX) |
10 μL |
25 μL |
1× |
|
Fremadprimer (10 μM)a |
0.4 μL |
1 μL |
0.2 μM |
|
Reverse Primer (10 μM)a |
0.4 μL |
1 μL |
0.2 μM |
|
Skabelonb |
Variabel |
Variabel |
efter behov |
|
Nuklease-frit vand |
Tilføj til 20 μL |
Tilføj til 50 μL |
en. Normalt kan en god amplifikationseffekt opnås med slutkoncentrationen på {{0}},2 μM. Når reaktionsydelsen er dårlig, kan primerkoncentrationen justeres i området 0.2-1.0 μM.
b. Mængden af template-tilsætning varierer afhængigt af antallet af kopier af målgenet, og den passende mængde template-tilsætning studeres ved gradientfortynding. Den bedste tilsætningsmængde af template-DNA i 20 μL reaktionssystemet var mindre end 100 ng. Når cDNA'et (RT-reaktionsopløsning) fra RT-PCR-reaktionen blev brugt som skabelon, bør tilsætningsmængden ikke overstige 10% af det endelige qPCR-volumen.
2. PCR-reaktionsprogram (kan justeres passende i henhold til instrumentet)
|
A. To-trins proces * |
B. Tre-trins proces* |
||||||||
|
Scene |
Trin |
Cykler |
Temperatur |
Tid |
Scene |
Trin |
Cykler |
Temperatur |
Tid |
|
Etape 1 |
Prædegeneration |
1 |
95 grader |
30 sek |
Etape 1 |
Prædegeneration |
1 |
95 grader |
30 sek |
|
Etape 2 |
Degeneration |
40 |
95 grader |
15 sek |
Etape 2 |
Degeneration |
40 |
95 grader |
15 sek |
|
Udglødning-forlængelse |
60 grader |
30 sek |
Udglødning |
55-65 grad |
10 sek |
||||
|
Forlængelse |
72 grader |
30 sek |
|||||||
|
Etape 3 |
Smeltekurve |
1 |
Instrument standardindstillinger |
Etape 3 |
Smeltekurve |
1 |
Instrument standardindstillinger |
||
*: Hvis amplifikationsspecificiteten skal forbedres, kan to-trins procedure eller annealingstemperatur anvendes; For at forbedre amplifikationseffektiviteten kan en tre-trins procedure eller forlængelsestid anvendes.
a: For fluorescenssignalopsamling skal du indstille den eksperimentelle procedure i henhold til instrumentets instruktionsmanual.
Note
1. Blandes forsigtigt på hovedet før brug. Undgå at hvirvle og ryste for at undgå bobler. Reagenser blandes godt før brug.
2. Reagenser skal placeres på is, når reaktionsopløsningen tilberedes.
3. Produktet indeholder fluorescerende farvestof SYBR Green, så stærkt lys bør undgås ved tilberedning af PCR reaktionsopløsning.
4. Brug venligst nye engangsspidser til klargøring og emballering af reaktionsopløsningen for at undgå kontaminering mellem prøverne.
5. Undgå gentagen fryse-optøning af Master Mix og prøv at bruge den inden for en måned efter optøning.
Kompatible instrumenter
|
Mærke af PCR-maskine |
G3320 (Ingen ROX) |
G3321 (Lav ROX) |
G3322 (Høj ROX) |
|
ABI termoliv |
PikoRealTM Cycler |
7500/7500 hurtig, ViiA 7™ QuantStudio™-serien |
5700/7000/7300/7700/7900/ 7900HT/7900 HT Fast, StepOne™, StepOne Plus™ |
|
Stratagene |
Mx3000P®/3005P™/4000™ |
||
|
Bio-Rad |
Alle serier |
||
|
Eppendorf |
Realplex 2s, Mastercycler®ep realplex |
||
|
IIIumina |
Eco QPCR |
||
|
Cepheid |
SmartCycler® |
||
|
Qiagen Corbett |
Rotor-Gene®-serien |
||
|
Roche |
LightCycler™-serien |
||
|
Takara |
Thermal Cycler Dice-serien |
||
|
Analytikjena |
qTOWER-serien |
||
|
qTOWER |
LineGene serien |
Primer Design Principper
1. Længden af amplifikationsproduktet anbefales at være mellem 80-300 bp;
2. Primerlængde: 18-25 bp;
3. Indholdet af base G+C i primere skal være mellem 40%-60%;
4. Tm-værdiforskellen mellem fremadgående primere og omvendte primere er mindre end 2 grader, og Tm-værdien mellem 58-62 grader er den bedste;
5. Tilfældighed af basisfordeling;
6. Primere må hellere ikke indeholde selvkomplementære sekvenser, ellers vil de danne en sekundær hårnålestruktur;
7. Der bør ikke være mere end 4 komplementære eller homologe baser mellem to primere, ellers vil der dannes primerdimer, især komplementær overlapning ved 3'-enden;
8. Den 3'-terminale base af primeren foreslås at være G eller C;
9. Der blev ikke fundet andre ikke-specifikke produkter i NCBI-sammenligningsresultater.
Fejlfinding
|
Problemer |
Mulige tilfælde |
Løsninger |
|
Ved slutningen af reaktionen fremkom ingen amplifikationskurve, eller CT-værdien forekom for sent |
Skabelonkoncentrationen er for lav |
Reducer antallet af skabelonfortyndinger for at gentage eksperimentet, startende med den højeste koncentration, hvis prøvekoncentrationen er ukendt. |
|
Nedbrydning af primere |
Forbered skabelonen og gentag eksperimentet. |
|
|
PCR-hæmmere til stede i reaktionsblandingen. |
Generelt skabelonoverførsel, øge skabelonfortyndingen eller genforbered skabelonen med høj renhed for at gentage eksperimentet. |
|
|
Mulig nedbrydning af primere |
Primere, der ikke har været brugt i lang tid, bør først testes for integritet ved PAGE-elektroforese for at udelukke deres nedbrydning. |
|
|
Lav forstærkningseffektivitet |
Forøg primerkoncentrationen, prøv et tre-trins amplifikationsprogram, eller redesign primerne. |
|
|
Forstærkningsprodukter for lange |
Amplifikationsproduktlængden blev kontrolleret til 80-300 bp. |
|
|
Forstærkningssignal i ikke-skabelonstyring |
Forurening af reaktionssystem |
· Skift først vandet i blindprøvekontrollen, hvis det samme stadig sker, fortsæt med at udskifte primere, spidser, PCR-rør eller aktivér en ny Master Mix; Reaktionssystemet er forberedt i en ultra-ren bænk for at minimere aerosolkontamination. |
|
Ikke-specifik amplifikation såsom primerdimere |
Generelt er det normalt, at amplifikationsprodukter vises i blindprøven efter 35 cyklusser, som bør analyseres sammen med smeltekurven; redesign primerne, juster primerkoncentrationen eller optimer PCR-reaktionsproceduren. |
|
|
Smeltekurven har flere toppe |
Primer design er suboptimalt |
Nye primere blev redesignet efter primerdesignprincipper. |
|
Primerkoncentrationen er for høj |
Reducer primerkoncentrationen passende |
|
|
Genomisk kontaminering i cDNA-skabelon |
Den ekstraherede RNA-opløsning fordøjes ved hjælp af DNA-enzymer, såsom dsDNase, for at fjerne genomisk kontaminering eller til at designe transintronprimere |
|
|
Dårlig reproducerbarhed af eksperimenter |
Fejlen ved at tilføje stikprøve er stor |
Brugen af nøjagtig pipette, med højkvalitets sugehoved nøjagtig pipette; Skabelon med høj fortynding, tilføjelse af skabelon med stort volumen for at reducere prøvetagningsfejl; Reaktionsvolumenet af qPCR blev forstørret |
|
Skabelonkoncentrationen er for lav |
Reducer skabelonfortyndingstiderne for at gentage eksperimentet. |
|
|
Temperaturafvigelse på forskellige steder af qPCR-instrumentet |
Kalibrer qPCR-instrumentet regelmæssigt |
|
|
Amplifikationskurven er ikke jævn |
Fluorescenssignalet er for svagt, produceret efter systemkorrektion |
Sørg for, at farvestofferne, der er forblandet i Master Mix, ikke nedbrydes; Udskift fluorescerende signal for at indsamle bedre qPCR-forbrugsstoffer |
|
Amplifikationskurven knækker eller glider |
Skabelonkoncentrationen var højere, og baseline-endepunktsværdien var større end CT-værdien |
Baseline-endepunktet (Ct-værdi -3) blev reduceret, og dataene blev genanalyseret |
|
Amplifikationskurver for individuelle brønde faldt pludselig kraftigt |
Der er bobler i reaktionsrøret |
Sørg for, at MIX er fuldstændig opløst, og lad være med at hvirvle og oscillere jævnt; Efter at prøven er tilsat, fjernes boblerne ved centrifugering med let elastik. Præ-denatureringstiden blev forlænget til 10 minutter for at fjerne boblerne |
Kun til forskningsbrug!
Populære tags: 2×sybr grøn qpcr master mix (ingen rox), Kina 2×sybr grøn qpcr master mix (ingen rox) producenter, leverandører, fabrik
